プロ・ナトゥーラ・ファンド助成では、自然保護のためのフィールドワークに基づいた基礎的な研究や、地域に根ざした自然保護活動、当財団が年度ごとに定める特定のテーマに取り組むプロジェクトに対して助成を行います。

〈助成対象とカテゴリー〉
A. 国内研究助成
日本国内における自然保護の基礎となる調査・研究

B. 国内活動助成
日本国内における自然保護のための保全・普及・啓発活動

地域NPO 活動枠
日本国内の地域のNPO による自然保護のための保全・普及・啓発活動

C.海外助成
開発途上地域における自然保護のための調査・研究、及び教育・普及・啓発活動

D.特定テーマ助成
①植物
日本国内における絶滅が危惧される植物（種あるいは群生地）の保全に関する研究・活動
②沿岸域・河口域
日本国内における沿岸域・河口域の生物多様性保全に資する研究・活動に対し助成